1、银离子抗菌剂干扰细胞壁的合成
细菌细胞壁重要组分为肽聚糖，银离子抗菌剂中的银离子对细胞壁的干扰作用，主要抑制多糖链与四肽交联有连结，从而使细胞壁失去完整性，失去了对渗透压的保护作用，损害菌体而达到杀菌效果。
2、银离子抗菌剂可损伤细胞膜
银离子抗菌剂可以损伤细菌细胞生命活动重要的组成部分，细胞膜。因此，如细胞膜受损伤、破坏，将导致细菌死亡。
3、银离子抗菌剂抑制蛋白质的合成
在银离子的作用下，细菌的蛋白质的合成过程变更、停止、使细菌死亡。
4、银离子抗菌剂干扰核酸的合成
阻碍遗传信息的复制，包括DNA、RNA的合成，以及DNA模板转录mRNA等。
银离子抗菌剂是如何达到杀菌不对正常细菌造成影响？
银离子抗菌剂之所以能杀菌而不伤害有益菌和正常细胞，是因为大部分的病原菌是单细胞微生物，是倚靠蛋白酶来维持新陈代谢，进而繁殖影响正常细胞，在这些蛋白酶之中还有一种氧代谢酶。
当银离子遇到这种氧代谢酶时，氧代谢酶的活性会抢走银的一个电子，使银原子变成带正电的银离子，银离子就会吸引蛋白酶中带有负电荷的硫醇基(-SH)的特异性结合，有效地刺穿细胞壁与细胞膜外表，进一步使细菌细胞因蛋白质变性，而无法呼吸、代谢和繁殖，直至细菌死亡，达到灭菌并且不伤害正常细胞的效果。